在汤森路透发布的《2013年度期刊引用报告》（JCR）中，《自然》（Nature）《自然通讯》（Nature Communications） 和《科学报告》（Scientific Reports）分别在多学科类科学期刊排名上占据第一、三、五位。
期刊影响因子是衡量期刊引用影响力的一个指标。《自然》影响因子42.351，2013年被引用高达590324次，至今已连续六年蝉联多学科类科学期刊第一名。在2013年度期刊引用报告科学版中，《自然》及其子刊共有10种跻身期刊前20强，并有17种期刊位居单一学科或多个学科类期刊的榜首。
《自然通讯》连续第二年保持多学科类科学期刊第三位，其影响因子上升到10.742。《自然通讯》也提供开放获取模式供作者选择，目前每月收到1500篇投稿，比《自然》多出50%。
开放获取期刊《科学报告》的被引用量则从2012年的500次升至2013年的超过4000次，影响因子5.078，在2013年期刊引用报告科学版收录的全部8474种刊物中，跻身排名最靠前的7%之列。“我们的开放获取期刊发表了不同科学领域的优质研究成果，并最大程度地与更多的读者分享这些成果。社交媒体的关注和新闻报道反映了它们的影响力已深入研究人员和公众。”自然出版集团暨帕尔格雷夫•麦克米伦负责开放研究的董事总经理山姆·伯里奇（Sam Burridge）说。
另一方面，2012年3月正式创刊的开放获取期刊《光：科学与应用》（Light: Science & Applications）获得创刊以来的首个影响因子，分值为8.476，在该报告收录的82种光学类期刊中位列第四，榜首则由《自然光子学》占据。
《光：科学与应用》是自然出版集团与中国科学院长春光学精密机械与物理研究所的合作期刊，也是自然出版集团在中国推出的第一个物理类开放获取合作期刊。
“我们的目标是将该刊打造为一个促进国际学术交流、合作和创新的平台，发表光学领域优秀的学术论文。”期刊总编暨中国科技部副部长曹健林说，“如今，这本期刊无疑在这一领域显示了重要影响力，为此我想向我们的作者、读者、编委、审稿人和有关工作人员表示感谢。”
山姆·伯里奇表示：“首个影响因子的发布，意味着自然出版集团与中科院长春光机所的合作取得了实质性的成功，并有助于提升中国光学研究的全球影响力。这符合我们通过我们的国际出版平台、建立互惠互利的伙伴关系，以及专注于出版高质量的开放获取期刊来促进中国科研发展的战略。”（编辑：Calo）